| ホヤ(海鞘)綱 Ascidiacea |
| | 1. 腸性(内性)目 Enterogona(生殖腺が腸環の中、あるいはその後方にある) |
| | | (1) 無管(樽鰓)亜目 Aplousobranchia(鰓嚢に横走血管のみをもつ) |
| | | | ・ポリクリニ科 Polyclinidae(=Synoichidae)(群) |
| | | | | Polycliniae:Aplidium(ミナミシモフリボヤ、マンジュウボヤ)Sidneioides(スナモチボヤ) |
| | | | | Enherdmaniae:nherdmania,Pseudodistoma(アンチンボヤ)、Ritterella |
| | | | ・ジデムニ科 Didemnidae(群):Leptoclinum(ネンエキボヤ) |
| | | | | Didemnum(シロウスボヤ) |
| | | | ・ポリキトリ科 Polycitoridae(=Clavelinidae)(群) |
| | | | | Polycitoriae:Polycitor(ヘンゲボヤ) |
| | | | | Claveliniae:Clavelina |
| | | | | Holozoinae:Distaplia(チラシボヤ)、Hypsistozoa,Sycozoa(カンザンボヤ) |
| | | (2)管鰓(網鰓)亜目 Phlebobranchia(縦走血管をもつが、鰓褶を欠く) |
| | | | ・キオナ科 Cionidae |
| | | | | Diazoninae(群)：Syndiazona(ボウズボヤ) |
| | | | | Cioniae(単)：Ciona(ユウレイボヤ) |
| | | | ・オクタクネミ科 Octacnemidae(単または群) |
| | | | | Perophoriae(群)：Perophora |
| | | | ・アスキジア科 Ascidiidae |
| | | | ・コレラ科 Corellidae(単)：Corella(アサムシボヤ) |
| | | | | Chelyosoma(スボヤ) |
| | 2. 壁性(側性)目 Pleurogona(生殖腺は対をなして白湯の筋膜内面にある) |
| | | (1) 褶鰓(剛鰓)亜目 Stolidobranchia(横・縦走血管をともにもち、鰓褶も発達する) |
| | | | ・ボトリルス科 Botryllidae(群)：Botryllusu(ミダレキクイタボヤ、ウスイタボヤ)、Botrylloides |
| | | | ・スチエラ科 Styelidae(群または単)：Symplegma(コバンイタボヤ)、Polyzoa(アラレボヤ)、
Metandrocarpa,Polyandrocarpa,Stolonica,Styela(シロボヤ、フタスジボヤ)、
Pelonaia,Polycarpa(クロボヤ) |
| | | | ・ピウラ科 Pyuridae(単)：Halocynthia(マボヤ)、Pyura |
| | | | ・モルグラ科 Molgulidae(単)：Molgula(マンハッタンボヤ) |
| | | (2) 無孔亜目 Aspiculata(鰓嚢をもたず、鰓孔は痕跡的である) |
| | | | ・ヘクサクロビリ科 Hexacrobylidae(単) |
